MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4704

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014132	T	7	7	14	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014132	CCG	2	6	127	132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014132	ATA	2	6	150	155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014132	CTCGC	2	10	221	230	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_014132	GAG	2	6	315	320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014132	TTA	2	6	1654	1659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014132	CAA	2	6	1707	1712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014132	T	9	9	1756	1764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014132	TAT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014132	A	6	6	1883	1888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014132	TA	3	6	1894	1899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014132	A	6	6	1905	1910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014132	TA	3	6	1916	1921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014132	A	6	6	1927	1932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014132	TA	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014132	TA	3	6	1969	1974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014132	TAA	2	6	1981	1986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014132	CAA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014132	TAA	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014132	AATTTC	2	12	8348	8359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014132	CAA	2	6	8382	8387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014132	GAA	2	6	8405	8410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014132	ATT	2	6	9129	9134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014132	CTA	2	6	9186	9191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014132	TTAA	2	8	9209	9216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014132	AAT	2	6	9224	9229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014132	AAT	2	6	9259	9264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014132	A	7	7	9340	9346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014132	TGC	2	6	9378	9383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014132	GAA	2	6	9390	9395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014132	A	6	6	9402	9407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014132	ATCA	2	8	9423	9430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014132	AAC	2	6	9436	9441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014132	TTAA	2	8	9443	9450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014132	T	6	6	10143	10148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014132	TAA	2	6	10203	10208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014132	AGACCA	2	12	10227	10238	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014132	TA	3	6	10246	10251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014132	ATT	2	6	10262	10267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014132	AAG	2	6	10275	10280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014132	GAC	2	6	10322	10327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014132	TAA	2	6	10328	10333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014132	GATTG	2	10	10337	10346	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014132	GTA	2	6	10369	10374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014132	AG	3	6	11299	11304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014132	TA	3	6	13474	13479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014132	CTA	2	6	13519	13524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014132	T	7	7	13543	13549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014132	ATA	2	6	13560	13565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014132	AAG	2	6	13574	13579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014132	TCA	2	6	13599	13604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014132	ATAA	2	8	13605	13612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014132	TTAA	2	8	13626	13633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014132	TTAT	2	8	13634	13641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014132	ATT	2	6	13645	13650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014132	TA	3	6	13665	13670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014132	TCT	2	6	14309	14314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014132	T	6	6	14342	14347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014132	A	6	6	14363	14368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014132	TTG	2	6	14385	14390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014132	T	8	8	14432	14439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014132	TTAA	2	8	14457	14464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014132	TTA	2	6	14466	14471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014132	TCAT	2	8	14478	14485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014132	GATT	2	8	14534	14541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014132	TTA	2	6	15873	15878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014132	ATT	2	6	15892	15897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014132	CAAA	2	8	15943	15950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014132	A	6	6	15948	15953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014132	A	7	7	15976	15982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014132	TTG	2	6	16011	16016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014132	TAA	2	6	16047	16052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014132	AAT	2	6	16057	16062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014132	AAAT	2	8	16077	16084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014132	TGA	2	6	16122	16127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014132	AAT	2	6	16137	16142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014132	GTT	2	6	16182	16187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014132	ACA	2	6	16237	16242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014132	TTG	2	6	16250	16255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014132	TA	3	6	16271	16276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014132	CTA	2	6	16327	16332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014132	TAT	2	6	16385	16390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014132	T	7	7	16419	16425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014132	CCTTT	2	10	17126	17135	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_014132	GAC	2	6	17180	17185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014132	ATT	2	6	17199	17204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014132	ATTG	2	8	17217	17224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014132	GA	3	6	17243	17248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014132	GC	3	6	17969	17974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014132	T	6	6	18119	18124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014132	TAT	2	6	18148	18153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014132	A	7	7	18257	18263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014132	CT	3	6	18324	18329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014132	CTA	2	6	18339	18344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014132	TC	3	6	18354	18359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014132	AT	3	6	18386	18391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014132	T	7	7	18411	18417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014132	AAATT	2	10	18423	18432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014132	AAAT	2	8	18438	18445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014132	ATT	2	6	18452	18457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014132	GAA	2	6	18468	18473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014132	AATTA	2	10	18498	18507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014132	TA	3	6	18510	18515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014132	T	6	6	19573	19578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014132	AAT	2	6	19579	19584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014132	T	6	6	22331	22336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014132	ATC	2	6	22356	22361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014132	A	7	7	22401	22407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014132	ATTA	2	8	22447	22454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014132	TTA	2	6	22498	22503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014132	TTA	2	6	23163	23168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014132	A	6	6	23180	23185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.